VisualCGH es una herramienta orientada a analizar y visualizar aCGHs segmentados desde diferentes plataformas. La herramienta permite cargar datos desde archivos CSV que siguen la estructura marcada por programas como Nimblegen. El objetivo principal de la herramienta es facilitar el análisis visual a través de la aplicación de varias visualizaciones y modelos de interacción por los usuarios. VisualCGH proporciona varias vistas, una vista acumulada para facilitar la selección de regiones mínimas y una vista de pérdida y ganancia por paciente para analizar variaciones por categorías o un nivel de paciente. Además, el sistema proporciona funcionalidades para seleccionar segmentos otoñales, generar informes y mostrar información como CNV o anotaciones.
El sistema es una iniciativa del grupo de investigación BISITE de la Universidad de Salamanca, el Centro de Investigación IBMCC de Salamanca-CSIC y el Servicio de Hematología del Hospital Universitario de Salamanca.